مطالعات مولکولی بر‌هم‌کنش بیمارگر‌ها و گیاه، ابزار مناسبی برای توسعه روش‌های جدید کنترل بیماری‌ها و ارزیابی ارقام مقاوم و حساس فراهم نموده است. microRNA ها گروهی از non coding RNAها هستند که در سلول نقش تنظیمی ایفاء می‌نمایند و فعالیت‌های گیاه را از طریق کاهش بیان ژن‌های هدف تحت تاثیر قرار می‌دهند. miRNAها مولکول‌هایی درون‌زاد و غیر کد‌کننده عملکردی می‌باشند که توالی آن‌ها حدود 20 تا 24 نوکلئوتید بوده و در سال‌های اخیر به‌عنوان تنظیم کننده‌های مهم، بیان ژن‌های کد کننده پروتئین مورد تحقیق قرار گرفته‌اند. این ریز RNA ها عملکرد خود را از طریق خاموش کردن ژن‌های هدف در سطح رونویسی Transcriptional gene silencing و یا در سطح بعد از رونویسی ژن‌ها Posttranscriptional gene silencingنشان می‌دهند. این ریز RNAها بسیاری از فرآیندهای سلولی را به‌وسیله تداخل با ترجمه و یا تخریب mRNAها تنظیم می‌نمایند. در گیاهان miRNAها بابیان متفاوت در تنظیم بسیاری از فرایندهای گیاه ازجمله رشد و توسعه، گل‌دهی، تمایز مریستم، پاسخ به نور، مرفولوژی برگ، تشکیل ریشه، پاسخ به تنش‌های زنده و غیرزنده و بسیاری از فرآیندهای سلولی که هنوز شناخته نشده‌اند نقش‌آفرینی می‌نمایند در سال‌های اخیر miRNAها به عنوان مولکول‌های پاسخ دهنده به بیماری‌های گیاهی مورد توجه قرار گرفته‌اند. از طرف دیگر بیماری سپتوریای برگی گندم که توسط قارچ Zymoseptoria tritici ایجاد می‌گردد، خسارت زیادی به این محصول استراتژیک در نقاط مختلف جهان و از جمله ایران وارد می‌نماید. بیمارگر مذکور در بر-هم‌کنش با گیاه دارای رفتار همی‌بیوتروف بوده و در 8-7 روز اول آلودگی علایمی را روی میزبان ایجاد نمی‌نماید. هدف از این مطالعه ارزیابی تغییر سطح بیان tae-miR408 و tae-miR444 در بر‌هم‌کنش قارچ Z.tritici با دو رقم گندم حساس (Taichung 29) و مقاوم (Arina) به بیماری سپتوریای برگی گندم می‌باشد. تغییر بیان این miRNA ها در دو رقم مذکور بوسیله RT-qPCR در 7،3،1،0 و10 روز بعد از آلودگی مورد تجزیه و تحلیل آماری قرار گرفت. نتایج به‌دست آمده بوسیله روش 2-∆ct نشان داد که سطح بیان tae-miR408 و tae-miR444 در رقم حساس در مقابل رقم مقاوم کاهش یافت. اهداف ژنی شناخته‌شده miR408 رونوشت ژن‌های Plantacyanin-like proteinو ژن (TaCLP1) chemocyanin-like protein و رونوشت تعدادی از ژن‌های Laccase می-باشند که در پیام‌رسانی سلول به سلول، تشکیل لیگنین، پاسخ به تنش‌ها، التیام زخم‌ها، گرفتن آهن، و نگهداری ساختار و تمامیت دیواره سلولی نقش دارند. همچنین از ژن‌های هدف شناخته شدهmiR444 اعضای خانواده فاکتورهای رونویسی MADS box می‌باشند که که به عنوان تنظیم‌کننده‌های بالادستی ژن‌های مرتبط با تنش‌ها شناخته‌شده‌اند و از اهمیت خاصی در القاء مقاومت به پاتوژن‌ها برخوردار است.
