صنوبر با نام علمی Populus spp. از تیره بید (Salicaceae) درختی با رشد سریع و ارتفاع زیاد است که به ویژه در شمال‌غرب و غرب کشور کاشته می شود و از جنبه های مختلف از جمله تولید چوب و در فضای سبز اهمیت زیادی دارد. طی سال های اخیر یک بیماری با علایم شانکر، پوسیدگی و خشکیدگی قسمتهای هوایی و در نهایت مرگ گیاه این درختان را با خطر جدی روبرو کرده است. هدف از این تحقیق شناسایی باکتریهای مرتبط با این بیماری بود. بدین منظور در بهار سال 93 و 94 از از قسمتهای پوست و شاخه و بخش‌هایی از تنه درختان دارای علائم بیماری در برخی مناطق شمال‌غرب و غرب ( زنجان، تبریز و کرمانشاه) نمونه‌برداری انجام شد. پس از انتقال نمونه‌ها به آزمایشگاه، جداسازی باکتریها به روش معمول خیساندن قطعات خرد شده هر نمونه در آب مقطر و کشت روی محیط کشت آگار غذایی انجام شد. برای شناسایی باکتریهای جدا شده، آزمون‌های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی مختلف و آزمون بیمارزایی انجام شد. همچنین، تعیین توالی قطعه 16S rRNA با دو آغازگر 17R و 1492F برای کمک در شناسایی باکتریها انجام شد. بیماری‌زایی جدایه‌ها در نهال‌های صنوبر گونه Populus nigra که بیشترین کشت را در این مناطق دارد، در گلدان در شرایط گلخانه ای مورد بررسی قرار گرفت. این آزمون با تزریق lµ100 از سوسپانسیون باکتری با غلظت cfu/ml 107 داخل آوندهای برگ و داخل جوانه و همچنین با برشهای عرضی در پوست انجام شد. علایم لکه برگی با حاشیه آبسوخته پس از 7 تا 10 روز و علایم نکروز شاخه ها در محل تزریق و اطراف آن پس از 3 تا 4 هفته مشاهده گردید. از قسمتهای دارای علایم باکتری مورد نظر مجددا جداسازی و با باکتری اولیه مقایسه گردید. براساس نتایج آزمون‌های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی انجام شده، باکتریهای بیماری‌زای جدا شده در دو گروه قرار گرفتند. گروه اول به جنس Xanthomonas تعلق داشتند، اما خصوصیات آنها با X. populi گزارش شده به عنوان عامل شانکر صنوبر در جهان، به طور کامل مطابقت نداشت. توالی 16S rRNA نماینده این گروه بیشترین شباهت را با X. campestris نشان داد. گروه دوم براساس نتایج آزمون‌ها و نیز تعیین توالی قطعه 16S rRNA کاملا با populi Microbacterium مطابقت داشت. این باکتری به عنوان عامل شانکر صنوبر در برخی از مناطق چین گزارش شده است و این اولین گزارش از بیماری‌زایی این باکتری روی صنوبر در ایران میباشد.
