آلسترومریا (Alstroemeria spp.) گیاهی تک لپه متعلق به راسته ی سوسن ها (Liliales) و خانواده‌ی آلسترومریاسه (Alstromeriace) می‌باشد. این گیاه به عنوان یکی از 10 گیاه زینتی مهم شاخه بریده در ایران و جهان محسوب می‌شود. خسارت ویروس ها در گیاهان زینتی به علت ماهیت محصول و کاهش بازار پسندی آن چشمگیرتر است. آلودگی آلسترومریا به ویروس ها به اشکال مختلف از جمله ایجاد لکه برگی‌های گسترده، موزاییک، بدشکلی گل، کوتولگی گیاه و در مواردی عدم تولید گل نمود می نماید. ویروس هایی که منجر به علایم موزاییکی برروی گیاه آلسترومریا می شوند؛ از جمله عواملی می باشند که منجر به کاهش بازارپسندی و افت محصول تولیدی می شوند. در این تحقیق تلاش برای شناسایی عامل علایم موزاییکی برروی گیاه آلسترومریا در استان های اصفهان و چهار محال و بختیاری صورت گرفت. برای این منظور، طی سال‌های 1393 و 1394 نمونه‌هایی که دارای علایم موزاییک، زردی و بدشکلی بودند؛ از گلخانه ها و گل فروشی های این استان ها جمع‌آوری شدند. پس از استخراج آر. ان. ا. کل، از آغازگر های عمومی و اختصاصی ویروس های آلوده کننده آلسترومریا شامل Alstroemeria mosaic virus (AlsMV)، Alstroemeria virus X (AlsVX)، Cucumber mosaic virus (CMV)، Freesia mosaic virus (FreMV)، Youcai mosaic virus (YoMV)، Broad bean wilt virus-2 (BBWV2) وPepper huasteco yellow vein virus (PHYVV) در RT-PCR استفاده شد. باند های مورد نظر تکثیر شده به صورت مستقیم یا پس از همسانه سازی در ناقل pJET1.2/blunt جهت تعیین ترادف به شرکت ماکروژن کره جنوبی ارسال شدند. مقایسه توالی ها با نرم افزار BLAST نشان داد باند های تکثیر شده در RT-PCR فقط مربوط به ویروس موزاییک آلسترومریا می باشند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ویروس موزاییک آلسترومریا، ژن کامل پروتیین پوششی جدایه هایی از این ویروس که بر اساس تیپ علایم و منطقه جمع آوری شده بودند، با استفاده از آغازگر های طراحی شده در نرم افزار FastPCR 6.5 تکثیر، همسانه سازی و تعیین توالی شدند. همردیف سازی توالی نوکلئوتیدی جدایه های ایرانی ویروس موزاییک آلسترومریا با جدایه های موجود در بانک ژن با استفاده از نرم افزار DNAMAN 4.0 به روش Neighbor joining انجام شد. نتایج حاصل از همردیف سازی نشان دهنده وجود شباهت بیش از 98 درصد با جدایه های ژاپنی (AB158522) ، چین تایپه (DQ295032) و نیوزلندی (FJ618527) ویروس موزاییک آلسترومریا موجود در بانک ژن بود. براساس اطلاعات ما این اولین گزارش از وجود ویروس موزاییک آلسترومریا در ایران می باشد. تصور می‌شود ویروس موزاییک آلسترومریا مهمترین عامل بیماری این گیاه در سرتاسر جهان باشد.
