Pseudomonas syringae یکی از گونه های باکتریایی بیماری زا است ،که دارای تنوع ژنتیکی ، فیزیولوژیکی و بیولوژیکی زیادی می باشد. شانکر و لکه برگی باکتریایی ناشی از P. syringae pv. syringae جزء مهم ترین بیماری های باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان خراسان رضوی محسوب می شود. توکسین ها گروهی از متابولیت های آلی ثانویه با وزن مولکولی پایین و طبیعت غیرآنزیمی هستند که حتی در غلظت های بسیار کم پروتئین موجب انحراف متابولیسم عادی گیاه و پیدایش کلروز یا نکروز می گردند. P. syringae pv. syringae فیتوتوکسین هایی از جمله syringomycin و syringopeptin تولید می کند که در فعالیت های فیزیولوژیک غشای سلولی اختلال ایجاد می نمایند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های توکسین زا و غیرتوکسین زای P. syringae جدا شده از درختان میوه هسته دار در استان خراسان رضوی ، نمونه هایی از برگ ها و سر شاخه های درختان هسته دار در طی فصل بهار سال 1392 جمع آوری شد. از میان 560 جدایه فلورسنت اکسیداز منفی جداسازی شده ، 84 جدایه از رشد قارچ Geotrichum candidum ممانعت نمودند. از بقیه جدایه های ناتوان در تولید توکسین ، 34 جدایه انتخاب شد. آزمون لوپات (لوان ، اکسیداز ، پکتیناز ، آرژنین دی هیدرولاز و فوق حساسیت توتون) روی تمامی استرین های انتخابی صورت گرفت و نتایج نشان داد که تمامی استرین ها متعلق به گونه P. syringae هستند. جهت بررسی تنوع ژنتیکی در میان جدایه های بدست آمده با یکدیگر از روش Rep PCR با پرایمر BoxA1R استفاده شد. الکتروفروز محصولات PCR با استفاده از ژل 1.5% آگاروز انجام شد. سپس، آنالیز داده ها با استفاده از برنامه NTSYSpc-V2.02e ، ضریب تشابهSimple matching و روش UPGMA صورت گرفت. در سطح شباهت 85% ، 12 گروه شناسایی شد. بنابراین نتایج نشان داد ، مارکر BoxA1R قابلیت گروه بندی جدایه های باکتریایی را دارد.
