بیماری پوسیدگی بذر و مرگز گیاهچه ناشی از Pythium.aphanidermatum یکی از مهم ترین بیماریهای گیاهان خانواده کدوییان ، به خصوص خیار است که موجب افزایش خسارت اقتصادی قابل توجهی به محصول در کشت های گلخانه ای و مزرعه ای می شود .با توجه به عدم کارایی روش های معمول برای کنترل و کاهش خسارت بیماری ، شناسایی تنوع ژنتیکی در جمعیت قارچ عامل این بیماری و معرفی ارقام مقاوم به بیماری یکی از راه های اصولی در کنترل این بیماری است . در سال های 1390 و 1391 تعداد 56 جدایه خالص قارچ عامل بیماری از گیاهان مختلف خانواده کدوییان در گلخانه ها و مزارع استان تهران تهیه گردید . تنوع ژنتیکی و قرابت بین این جدایه ها با استفاده از روش rep – PCRو با به کارگیری آغازگرهایERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت . داده های حاصل با نرم افزار NTSYS-pc تجزیه و تحلیل شد.براساس ضریب تشابه دایس جدایه ها در سطح تشابه 66٪ به هفت گروه تقسیم بندی شدند که نشان دهنده وجود تنوع ژنتیکی بالایی در جمعیت قارچ عامل بیماری در منطقه بود . با توجه به نتایج این بررسی rep – PCR روش مناسبی برای شناسایی تنوع ژنتیکی در قارچ P.aphanidermatum تشخیص داده شد.