پاتووارهای Pseudomonas syringae عامل بیماری های متعددی روی میزبان های زراعی و باغی است. در این تحقیق تعدادی از تعدادی از جدایه های P. syringae pv syringae جداسازی شده از گیلاس، هلو و گلابی، P. syringae pv. lachrymens جداسازی شده از خیار وPseudomonas savastanoi جداسازی شده از یاسمن زمستانی، جهت بررسی تنوع ژنتیکی استفاده شد. جدایه ها از مناطق مختلف استان فارس، کرمان و اصفهان تهیه شده اند. شناسایی جدایه ها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام شد. از آغازگرهای IS50 و BOX جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایه ها در روش BOXوIS50–PCR استفاده گردید. محصول PCR در ژل آگارز 1٪ الکتروفورز شد. از ضریب جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه ها و از روش UPGM و نرم افزارVersion 2.02 NTSYSPC برای آنالیز خوشه ای داده ها استفاده شد. نتایج بدست آمده با آغازگرهای آغازگرهای IS50 وBOX قادر به تفکیک جدایه ها به سه گروه اصلی شامل جدایه های Pseudomonas savastanoi ، P. syringae pv. lachrymens و P. syringae pv syringae و ده زیر گروه بود.
