باکتری Pseudomonas syringae بیمارگر اقتصادی مهمی است و پاتوورارهای زیادی دارد. در این تحقیق تعدادی از جدایه های P. syringae pv syringae عامل شانکر درختان میوه جداسازی شده از گیلاس، هلو، گلابی و P. syringae pv lachrymens عامل لکه زاویه ای خیار جداسازی شده از خیار از مناطق مختلف استان فارس، کرمان و اصفهان، جهت بررسی تنوع ژنتیکی مورد استفاده قرار گرفت. از آغازگرهای REPIR/REP2I وERIC2R /ERICIR جهت تکثیر قطعات، بین نواحی حفاظت شده در روش rep-PCRاستفاده گردید. محصول PCR در ژل آگارز 2٪ الکتروفورز شد. از ضریب جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه ها و از روش UPGM و نرم افزار Version 2.02 NTSYSPC برای آنالیز خوشه ای داده ها استفاده شد. نتایج بدست آمده با آغازگرهای REPIR/REP2I وERIC2R /ERICIR قادر به تفکیک جدایه ها به دو گروه اصلی در سطح تشابه 55٪ شامل جدایه هایP. syringae pv lachrymens وP. syringae pv syringae بود.
