باکتری Pseudomonas syringae دارای بیش از 57 پاتووار می باشد. در این تحقیق تعدادی از جدایه های P. syringae pv syringae عامل شانکر درختان میوه و P. syringae pv lachrymens عامل لکه زاویه ای خیار، جداسازی شده از میزبان ها و مناطق مختلف استان فارس، کرمان و اصفهان، جهت بررسی تنوع ژنتیکی استفاده گردید. از آغازگرهایH13, G13, 80.8, 70.8, 70.9 جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایه ها در روش RAPD-PCR استفاده شد. محصول PCR در ژل آگارز 1٪ الکتروفورز شد. از ضریب جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه ها و از روش UPGM و نرم افزار Version 2.02 NTSYSPC برای آنالیز خوشه ای داده ها استفاده شد. نتایج بدست آمده با آغازگرهای H13, G13, 80.8, 70.8, 70.9 قادر به تفکیک جدایه ها به دو گروه اصلی شامل جدایه های P. syringae pv. lachrymens و P. syringae pv syringae و هشت زیر گروه بود.
