متابولیت های ثانویه شامل تمام ترکیباتی است که یک قارچ در طول دوره رشدی خود قادر است روی محیط کشت تولید کند از جمله مهم ترین آنها آنتی بیوتیک پنی سیلین می باشد که توسط قارچ های رشته ای از جمله آسپرژیلوس و پنی سیلیوم تولید می شود. در این بررسی ابتدا قارچ های P. mali و P. cammuniو P. citrinum در محیط PDB کشت و 14 روز بعد از رشد قارچها، مراحل استخراج آنتی بیوتیک انجام شد و پس از خشک شدن، نمونه ها در 1 میلی لیتر استونیتریل حل و آنالیز نمونه ها توسط HPLC انجام شد. در کروماتوگرام های حاصل از HPLC نمونه استاندارد penicillin G حدودا در دقیقه 15 خارج شده است با توجه به این می توان گفت ترکیب مورد نظر ( penicillin G ) در گونه های P. mali و P. citrinum وجود داشته و در گونه P. cammuni دیده نشده است. در این بررسی میزان پنی سیلین G استخراج شده در گونه P. mali،33.8 میکروگرم بر میلی لیتر و در گونهP. cammuni ، 124.9 میکروگرم بر میلی لیتر می باشد.