توت فرنگی یکی از مهم‌ترین محصولات توتی جهان است. پوسیدگی سیاه ریشه یک بیماری شایع توت‌فرنگی است که باعث مرگ ریشه‌های تغذیه‌کننده و تخریب ساختار ریشه می‌شود. اطلاعاتی در رابطه با تنوع ژنتیکی گونه‌های رایزکتونیا عامل پوسیدگی سیاه ریشه توت فرنگی در ایران وجود ندارد. بنابراین این پژوهش با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های Rhizoctonia fragariae انجام شد. به این منظور 50 جدایه R. fragariae از روی گیاهان بیمار توت‌فرنگی در ایران که بیماری‌زا بودند جمع‌آوری شدند. سپس با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و آغازگرهای ITS1 و ITS4 ناحیه Internal Transcribed Spacer(ITS) تکثیر و باندی به وزن 670 جفت باز تکثیر شد. از هضم آنزیمی این ناحیه با استفاده از سه آنزیم برشی Tru1I، HinfI و BsuRI 20 قطعه حاصل شد که 16 قطعه چند شکلی نشان دادند. حداکثر قطعات دارای چند شکلی مربوط به آنزیم TrulI با 9 قطعه بود. تجزیه خوشه‌ای نتایج حاصل ازITS-Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP) با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA نشان داد که در سطح تشابه70% دوازده گروهRFLP وجود دارد. هیچ ارتباط معناداری بین گروه‌های RFLP و محل جمع‌آوری جدایه ها مشاهده نشد.
